Vytauto Didžiojo universiteto Kauno botanikos sode daugiametės gėlės pradėtos auginti nuo pat sodo įkūrimo 1923 m. Iš pirmųjų introdukuotų augalų išliko keletas puikiojo bijūno bei rožių veislių, atvežtų iš Prancūzijos ir Vokietijos. Pagrindinė daugiamečių gėlių kolekcijų dalis sukaupta sėklų mainų su kitais botanikos sodais būdu. Daug gyvų augalų gauta iš vietinių selekcininkų ir kolekcininkų, parsivežta iš kitų botanikos sodų. Gėlių ekspozicijos ir kolekcijos užima 2,5 ha plotą centrinėje botanikos sodo dalyje, čia auga 3800 rūšių, veislių ir formų augalai. Daugiamečių augalų virš 900 rūšių ir veislių augalų. Gėlynai ekspozicijose išdėstyti sistematiniu, bioekologiniu ir estetiniu principais. Sodo lankytojai gali susipažinti su dekoratyviomis gėlių rūšimis, kilusiomis iš JAV, Europos, Azijos bei Šiaurės Afrikos.
Lietuviškoms puikiojo bijūno veislėms ‘Garbė Motinai’, ‘Prof. K. Grybauskas’, ‘Virgilijus’ ir 16 hibridų suteiktas augalų nacionalinių genetinių išteklių (ANGI) statusas. 2008 m. įkurtos 2 lietuviškų veislių puikiojo bijūno (Paeonia lactiflora) lauko kolekcijos: O. Skeivienės ir J. E.Tarvydų bijūnų veislėms. VDU Kauno botanikos sodo gėlininkai organizuoja seminarus studentams ir visuomenei, studentai atlieka praktikas. Skelbiamos gėlių žydėjimo savaitės, dalyvaujama skintų gėlių parodose.
Siūlome lankytojams apžiūrėti gausias dekoratyvinių augalų kolekcijas: astilbių (Astilbe Buch. – Ham. ex D. Don); flioksų (Phlox L.), bijūnų (Paeonia L.), jurginų (Dahlia Cav.), vilkdalgių (Iris L.), lelijų (Lilium L.), viendienių (Hemerocallis L.), tulpių (Tulipa L.) – 8 rūšys ir 404 veislės;
Tvenkinio saloje yra didelė svogūninių ir kitų vienskilčių augalų rūšių ir veislių kolekcija: vėlyviai (Colchicum L.), žydrės (Muscari Mill.), scylės (Scilla L.), svogūnai (Allium L.), melsvės (Hosta Tratt.).